Las casas de los muiscas, llamadas bohíos o malokas, eran estructuras circulares hechas de postes de madera y paredes de arcilla, con un techo de junco cónico. Una larga columna de madera sostenía el techo en el centro de la estructura redonda y estaba unida a los postes de madera El interior del techo estaba decorado con telas con finas pinceladas de diferentes colores. En el piso se colocó paja fina. Algunos bohíos, probablemente los de los caciques tenían pisos de cerámica, como lo demuestran los hallazgos en Mosquera. Esto fue algo atípico para las casas Muisca.
A pesar de que los cronistas españoles han informado "poblaciones grandes" de territorios Muisca, las personas vivieron en poblamientos pequeños, descritos por los españoles conquistadores cuando "caseríos dispersos". Como el pueblo maya, los muiscas relacionaban los asentamientos más pequeños con su agricultura efectiva Las casas en la sabana de Bogotá fueron construidas en áreas ligeramente elevadas para evitar las inundaciones de varios ríos, humedales y pantanos, característicos de la zona. Cada comunidad tenía sus propias tierras de cultivo y terrenos de caza que rodeaban sus casas
